Los macroproyectos y proyectos se desarrollan en el marco de cinco líneas de investigación, trazadas en consonancia con las Agendas Zonales de Planificación:

• Educación, sociedad y tecnologías educativas.
• Gestión empresarial, responsabilidad social y competitividad de la empresa ecuatoriana.
• Gestión de destinos, productos y organizaciones turísticas.
• Investigación, gestión del conocimiento, tecnologías de la informática y las comunicaciones.
• Sistemas económicos, economía internacional, globalización, desarrollo.
• Salud humana, animal, planta y del ambiente.
• Procesos de producción industrial y tecnologías de protección del medio ambiente.
• Política, ciudadanía y estado social de derecho.

La producción científica de la UTEG, está fundamentada en procesos de investigación formativa a nivel de grado, investigación a nivel de posgrado e investigación científica, propiamente dicha.